Modifitseeritud tärklis on pulbriline materjal, nii et see, kas see on töötlemise ajal altid aglomeratsioonile, sõltub suuresti materjali seisukorrast ja tegelikust töömeetodist. Kui modifitseeritud tärklis on korralikult ladustatud ja hajutatud, võib see üldiselt säilitada hea pulbri seisukorra. Kuid kokkupuude niiskusega, kontsentreeritud söötmine või ebapiisav segamine töötlemise ajal võivad põhjustada lokaalset agregatsiooni ja tükkide moodustumist.
Niiskuse neeldumine on üks levinumaid tegureid, mis võib kaasa aidata aglomeratsioonile. Kui modifitseeritud tärklise pulber puutub kokku veega, võivad osakesed niiskust kiiresti imada, pannes need üksteise külge kinni. Kui niiskete osakeste ümber koguneb jätkuvalt suur kogus kuiva pulbrit, võivad tekkida tükid. Kui sellised tükid tekivad, võivad nende õigeks hajumiseks vajada täiendavat segamisaega.
Söötmisviis võib samuti oluliselt mõjutada aglomeratsiooni. Kui lisatakse korraga suur kogus modifitseeritud tärklist, võib pulber kontsentreeruda konkreetses materjali piirkonnas. Kui kohalik kontsentratsioon suureneb kiiresti ja saadaolev niiskus või segunemisvõime on ebapiisav, võivad osakesed üksteise külge kleepuda. Seetõttu ei tohiks praktiliste toimingute puhul üldjuhul korraga suuri koguseid pulbrit samasse kohta valada. Selle asemel tuleks materjali lisada järk-järgult vastavalt töötlemistingimustele.

Segamise tõhusus on veel üks oluline tegur. Kui modifitseeritud tärklist ei segata kohe ja ühtlaselt pärast lisamist, võib pulber jääda teatud piirkondadesse kontsentreerituks ja moodustada järk-järgult agregaate. See võib olla eriti märgatav väga viskoossete materjalide puhul, kus materjali üldine liikumine on suhteliselt aeglane ja pulbrit on raskem hajutada. Seetõttu tuleks järgida materjali omadustele vastavat segamist, et modifitseeritud tärklist saaks võimalikult tõhusalt kogu süsteemis jaotada.
Modifitseeritud tärklise säilitustingimused enne kasutamist võivad samuti mõjutada selle käitumist töötlemise ajal. Kui materjal on juba enne kasutamist niiskust imanud või sellele on tekkinud silmnähtavad tükid, võib seda olla raskem hajutada isegi siis, kui järgnevaid töötlemistingimusi korralikult kontrollitakse. Seetõttu on oluline enne kasutamist kontrollida pulbri seisukorda. Kui leitakse ilmseid kõrvalekaldeid, tuleks materjali enne töötlemissüsteemi viimist hinnata.
Töötlemise ajal aglomeratsiooni ohu vähendamiseks võib võtta mitmeid meetmeid. Esiteks tuleks modifitseeritud tärklist hoida võimalikult kuivana ning kasutamise ajal tuleks minimeerida tarbetut kokkupuudet õhu ja niiskusega. Teiseks tuleks kasutusele võtta sobiv söötmisviis, et vältida suure koguse pulbri lisamist lühikese aja jooksul. Kolmandaks tuleks pärast lisamist segada piisavalt, et tagada modifitseeritud tärklise ühtlane jaotumine kogu materjalisüsteemis.
Kui töötlemise ajal tekib aglomeratsioon, tuleks kõigepealt kindlaks teha selle põhjus. Kui probleemi põhjuseks on peamiselt liiga kiire söötmine, võib abiks olla söötmisviisi kohandamine ja hajutamise parandamine. Kui probleem on seotud materjali niiskuse seisundi või ebapiisava segamisega, tuleks üldist töötlemisprotseduuri vastavalt kohandada. Alati ei piisa lihtsalt segamisaja pikendamisest, sest erinevad aglomeratsiooni põhjused nõuavad erinevaid lahendusi.
Seetõttu ei pruugi modifitseeritud tärklis töötlemise ajal tingimata aglomereeruda. Kui materjali ladustatakse õigesti ning etteandmis-, hajutamis- ja segamisprotsesse on nõuetekohaselt kontrollitud, saab tükkide teket märkimisväärselt vähendada, aidates modifitseeritud tärklisel säilitada häid töötlemisomadusi ja saavutada paremaid kasutustulemusi.

